
2024年9月由成都渔业师范大学张万刚客座教授销售团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化绘制组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
常常标题格式:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年反应成分:5.7
刊出时候:2024年9月
顾客的单位:南京农业大学
论述相关材料:蛋白
拜谱展示 技艺:亚硝基化修饰组学
高技术行车路线:
一、实验的结果
01.Caspase-3活力性
现如今尚不很明白NO对caspase-3的缓和目的有无归因于NO介导的S-亚硝基化,有所不同密度系数的GSNO为外源性NO销售,以介导caspase-3的离体S-亚硝基化。导致显示,与没能GSNO的组相对,100、200和400μM GSNO组的caspase-3抗逆性偏态较低(图1),与之前有关报道不一。GSNO处里较低caspase-3抗逆性的内在的理由仍尚需展现。
图1 有所不同浓度值的GSNO外理对caspase-3活性酶的引响
02.Caspase-3的S-亚硝基化阶段
理论探析Caspase-3的亚硝基化限度,以表述GSNO对Caspase-3的发应性。经GSNO治理后,测试到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化抗拉强度多(图2)。以上不过表述,外源性GSNO锻炼可成功的引诱caspase-3的身体外S-亚硝基化。最令 惊呆的是,在找不到GSNO长期存在的照表组中测试到这个不大的S-亚硝基化带,这表述caspase-3概率进行内源性的S-亚硝基化。不仅如此,本理论探析中caspase-3的S-亚硝基化限度较高,而caspase-3的化学活化变低,这与前面的理论探析相一致。不过,caspase-3的特喜欢的人S-亚硝基化修饰语位点尚不弄清楚,还要有进1步的研究。
图2 GSNO工作对caspase-3S-亚硝基化层次的关系
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化掩盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。黑色标上的字段说道S-亚硝基化肽,紫色标上的C说道S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3溶解结蛋清
结核球球蛋清质酶质酶酶作的一种决定性的癌細胞骨架核球球蛋清质酶质酶酶,在长期保持肌癌細胞组成类型的组成类型删改性和膨胀性的方面起着决定性帮助,设计S-亚硝基化caspase-3对结核球球蛋清质酶质酶酶光可降解的特别敏各样具决定性重大意义。与Std(未用胱天核球球蛋清质酶质酶酶酶-3和GSNO孵育的初始值肌钎维核球球蛋清质酶质酶酶)组较之,0 μM GSNO组(肌原钎维和caspase-3的孵育,无GSNO)的删改结核球球蛋清质酶质酶酶的分量可观减少,提示卡caspase-3对结核球球蛋清质酶质酶酶具未知的核球球蛋清质酶质酶酶水解反应效率。在GSNO孵育后,删改结核球球蛋清质酶质酶酶的的分量显眼多(P < 0.05)。凡此种种,当GSNO氨水浓度提升时,删改结核球球蛋清质酶质酶酶的的分量不间断调涨(P < 0.05)(图5)。相应出现是因为,SNO突显的caspase-3以标准依靠的的方法减弱结核球球蛋清质酶质酶酶的光可降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3化学降解结血清
05.S-亚硝基化Caspase- 3溶解肌钙血清-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清都可以缓解负责管理身体肌肉弯曲的细条的必备肌原黏胶弹性纤维材料血清。TnT的生物吸附塑料特征英文是查重到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提下,caspase-3对TnT的生物吸附塑料条件如下图一样6一样,与Std组(会含caspase-3和GSNO的肌原黏胶弹性纤维材料)不同于,caspase-3组中30 kDa TnT场面性别差异性增长,是因为caspase-3参于了TnT的生物吸附塑料,不仅如此,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT越来越低。在100和200 μM GSNO组相互间没查重到明显的的性别差异(P > 0.05),而当GSNO的溶度高达400 μM 时,该场面性别差异性变少(P < 0.05)。这部分找到是因为了SNO遮盖语的caspase-3对TnT生物吸附塑料的调控目的。结血清和TnT是caspase-3的强烈底物,而GSNO工作减轻caspase-3的几丁质酶应该造成的肌原黏胶弹性纤维材料血清生物吸附塑料的程度减轻。笔者认为提出的,NO引发的S-亚硝基化都可以借助遮盖语半胱氨酸残基来都可以缓解caspase-3的几丁质酶,必将进一个步骤作用其对结血清和TnT的血清蛋白质水解能力素质,为了作用牛羊肉品控。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙核蛋白-T
二、工作小结
本学习有何意义探究S-亚硝基化对caspase-3绘制的以至于和接着随后对牛羊肉肌原棉纤维棉离体可降解的以至于。球淀粉酶S-亚硝基化会绘制caspase-3的半胱氨酸残基,而使以至于caspase-3活性氧减轻,进两步压制了其对牛羊肉肌原棉纤维棉球淀粉酶的球淀粉酶电离的能力。三、拜谱个人心得体会
设计采用了了酶活测得,亚硝基化绘制组学定量分析,WB等监测手法,感觉淀粉酶S-亚硝基化可不可以绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这造成了caspase-3可溶性的影响,相结十步抑止了其对鸡肉肌原纤维板淀粉酶的淀粉酶淀粉水解作用。本设计为释疑淀粉酶质亚硝基化对口感的改善逻辑出具了一大个新的第一视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的淀粉酶酶质组学、淡化淀粉酶酶质组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸国产產品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total阳极氧化完美重现、游离于巯基,欢迎大家咨询!
选取专著:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663