
太平洋西北国家实验室生物科学部的Tong Zhang,等在Redox Biology发表了题为“Regulation of hyperoxia-induced neonatal lung injury via post-translational cysteine redox modifications”的文章。该研究在暴露于高氧环境下的Scnn1b过表达小鼠中观察到大量的SSG变化,这表明ENaC在细胞调节中起着至关重要的作用。通过TMT淀粉酶质组和谷胱甘肽呈现淀粉酶质酚类化合物析,发现Scnn1b过表达可能通过调节细胞粘附、凝血和蛋白水解等特定过程来保护高氧诱导的肺损伤。这项研究提供了肺中蛋白质氧化的全景视图,并强调了氧化还原调节在O2 诱导的肺损伤中的重要性。
的文章名稱: Regulation of hyperoxia-induced neonatal lung injury via post-translational cysteine redox modifications(Redox Biology, 2022, IF=11.4)
研究探讨原材料:Scnn1b过表达小鼠、野生型小鼠
组学技术工艺:谷胱甘肽修饰蛋白质组、TMT蛋白质组
PART.01
探究方法
PART.02
探讨效果
1.慢性型高氧下一新儿转遗传基因Scnn1b肺表型
为了能让手机验证上皮钠通路在消减阳极空气氧化断裂中吊车要效用,科研者们对其进行了什么是生化分折和质谱检验。如图下图1A-C下图,WT小鼠慢牲吸到Fi O 2和Scnn1b过阐明方式小鼠都行以提升毁掉分指数、嗜普通粒肿瘤细胞侵及、阳极空气氧化应激状态状态,而慢牲高 O 2爆出相关性变低Scnn1b过阐明方式肺的他们参数值。除此之外,与维系在慢牲85% Fi O 2爆出下的WT肺不同之处,转表观遗传Scnn1b肺中参与性促钎维棉化反映表观遗传的mRNA水准相关性较低(图1D-F)。依据MS球高蛋白组学分折,常规氧下的转表观遗传Scnn1b小鼠的污染监测BALF肺断裂和应激状态状态的标记符号符号物水准明显的低于WT小鼠,高氧要能逐渐一个脚印介导他们标记符号符号物的水准(图1G-I)。他们最后阐明Scnn1b的过阐明方式小鼠主要表现出肺断裂和慢性感染水准的身高,但也许 对高氧爆出介导的肺断裂/慢性感染和钎维棉化体现了内在的的保护的效用。
图1 Scnn1b转DNA肺在萎缩性高氧下的表型
2.高氧诱导性下的整体性核蛋白表明变迁
从而甄别每样人类人类染色体型在高氧曝露后丰度再次发生不错发生改变的球核苷酸,来了人类人类染色体精神力分析一下,结果显示表述“空气氧化完美重现时候”是四种人类人类染色体型共要的最大要且独一的路径(图2A)。在该路径的四种人类人类染色体型都看到NDUA6和NDUS1,并某一种在高氧能力下都行为 出丰度的才能减少(图2B)。应用场景“几丁质分离成排泄时候”的治愈,在慢性强氧下转人类人类染色体Scnn1b小鼠的几丁质分离成排泄深受了骚扰,涉及到CHIA、CHIL3和CHIL4的不错下跌(图2C)。总而言之提出的,高氧诱惑转人类人类染色体Scnn1b小鼠的球球蛋白发生改变比野山型小鼠更好地样化。
图2 高氧会反应指定区域生物体过程中中核胆固醇的丰度
3.高氧分析的蛋清质SSG遮盖的變化
本实验借助不同遮盖的Cys位点来肯定SSG转换对高氧不起作用的淀粉酶质和经过。在SSG遮盖中还具重要性系数变的这么多淀粉酶质的人类表观遗传组本体论论证明,高氧必要条件下很多种不同微生物工程步骤在天然的型或转人类表观遗传组Scnn1b小鼠中强烈吃太多传达(图3A)。在转人类表观遗传组Scnn1b小鼠中,“血细胞吸附”被觉得是最具代表会性的分类,且转人类表观遗传组小鼠的Cys位点比天然的型小鼠多(图3B)。再者,血浆凝结重要性的高端微生物工程步骤中包含有Cys位点的淀粉酶,在转人类表观遗传组Scnn1b小鼠高氧后首要行为出上浮的谷胱甘肽化(图3C)。对“淀粉酶溶解”分类很深入的考察证明了很多种不同还具SSG水平面变换的Cys位点的淀粉酶质(图3D)。
图3 高氧应响小鼠肺中与好几种生物工程学具体步骤对应的血清质的谷胱甘肽化
4.高氧引发的血清质总被氧化的的变化
采用校正血清质硫醇总钝化来查证关于幼儿园血清质SSG的出现是否有合适,报告反映出Cys位点的SSG和总钝化数据源显示集期间有极强的涉及到的性(图4A)。等数据源显示还更加注重了在SGG或总钝化平均平行下,其Cys位点钝化平均平行获得高氧扰动,这反映出SSG是血清质半胱氨酸钝化平均平行的判断标准规范最为(图4B)。
图4 高氧后过形容Scnn1b小鼠Cys位点的总巯基氧化反应
5.TMT营养物质质组的区别调控促进企业SCNN1B的保护措施用
本研究探讨致力于断定几率不利于上皮钠通畅的β亚基(β-ENaC)对高氧引导的肺直接损伤的确保意义的血清质。总血清丰度的分折探求了多种人类基因型小鼠两者的差异改善的血清质。一些血清质参与进来了差异的海洋物理学具体步骤,比如血清质叠折、ATP分解和细胞系器组织结构(图5A)。然而另外的非常多血清质在也是型小鼠中体现出丰度的曾加,比如与氧化反应应激反应密切联系重要性的血清质叠折(图5B-C)。
图5 过描述Scnn1b促使高氧分析的蛋清丰度变现的差异化控制
PART.03
个人心得体会
肺谷胱甘肽淡化淀粉酶酶质组与TMT淀粉酶酶质组的结果表明高氧不会引起氧化还原稳态的剧烈干扰。此外,Scnn1b过表达可能通过调节细胞粘附、凝血和蛋白水解等特定过程来保护高氧诱导的肺损伤。SSG对特定蛋白质的调节的新发现加深了我们对肺对高 O 2反应的氧化还原调节作用的理解,强调了氧化还原调节在肺部的重要性。
PART.04
拜谱总结
谷胱甘肽(GSH)是哺乳动物细胞内丰度最高的低分子抗氧化剂,对维持细胞氧化还原状态具有重要作用。蛋白质的S-谷胱甘肽修饰可改变蛋白的结构,影响蛋白质的复合体形成以及多种细胞学功能。拜谱生物学看作二家境内遥遥领先的两组学有限公司,在半胱氨酸阳极氧化还原故宫场景遮盖域组积累更多了多样的工程经验丰富,成功助力Nature文章发表,可提供棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、次磺酸性反应、硫巯基化、Total 氧化反应回归、分散巯基营养素质组学拜谱生物,其中谷胱甘肽修饰蛋白质组目前可鉴定超过2000多种的蛋白质,欢迎大家咨询!
可以参考论文文献:Zhang T, Day NJ, Gaffrey M, Weitz KK, Attah K, Mimche PN, Paine R 3rd, Qian WJ, Helms MN. Regulation of hyperoxia-induced neonatal lung injury via post-translational cysteine redox modifications. Redox Biol. 2022; 55:102405. doi: 10.1016/j.redox.2022.102405.